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蛋白質組學【入門必看】| 帶你走進蛋白質組學-百趣生物

分類:公司動態   發布時間 2021-07-27   閱讀: 598

蛋白質組學這么火,你還沒有入門?今天小趣整理了小白必看的幾個關于蛋白質組學的問題和基礎知識,跟大家一起分享,帶領大家走進蛋白質組學的世界~

蛋白質組學名詞解釋:

蛋白質組學主要以全蛋白組(組織、細胞和器官)、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象,通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析,揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預測蛋白的上、下游變化關系。

蛋白質組學可以克服核酸水平預測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。

蛋白質組學常用技術

1. 非靶向蛋白組學

1.1 蛋白質定性(膠條鑒定和溶液鑒定)

1.2 高通量定量蛋白組(Label free、 iTRAQ/TMT 和 DIA 定量)

1.3 多肽組學

2. 靶向蛋白組(PRM 靶向蛋白/肽段定量)

3. 修飾蛋白組學(定量磷酸化修飾組學、定量糖基化修飾蛋白組學、定量乙;揎椀鞍捉M學和定量泛素化修飾蛋白組學)

4. 互作蛋白組學(代謝物與蛋白互作研究)


     蛋白質組學儀器平臺

百趣生物儀器平臺



       蛋白序列數據庫

最常用 Uniport 數據庫,第二優先級是 GeneBank/NCBI 數據庫,最次選擇 RNA sequence 序列信息進行氨基酸轉換。

搜索軟件

Proteome Discovery、Mascot、SEQUST、MaxQuant

     基本流程

蛋白質組學基本流程



     分析結果展示


1. 基礎分析

 數據預處理

 差異表達蛋白篩選


2. 常規數據分析


 主成分分析

火山圖分析

層次聚類分析

3.功能分析

 COG 注釋分析

亞細胞定位分析

GO 注釋富集分析

KEGG 注釋富集分析

PPI 網絡構建分析

4.修飾蛋白特有分析

Motif 分析

激酶(kinase)預測分析

今天小趣關于蛋白質組學名詞解釋、常用技術、儀器平臺、分析結果展示等基礎概念就分享到這里了,下期小趣將跟大家分享“常見蛋白質組學技術流程匯編”,敬請期待!

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