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BIOTREE植物高通量靶標代謝組學產品全新升級

分類:公司動態   發布時間 2020-07-29   閱讀: 1797

目前代謝組學研究面臨兩大難題:
生物體內小分子種類繁多→物質鑒定難;
生物體內小分子濃度相差懸殊(≥109)→物質定量難。

主流技術對比
代謝組學

擬靶標技術的發展:第一代

儀器:4000 QTRAP/5500 QTRAP
特點:低分辨,SIM檢測模式

代謝組學
Chen W , Gong L , Guo Z , et al. A Novel Integrated Method for Large-Scale Detection, Identification, and Quantification of Widely Targeted Metabolites: Application in the Study of Rice Metabolomics[J]. Molecular Plant, 2013, 6(6):1769-1780.

擬靶標技術的發展:第二代

儀器:5600 TripleTOF + 5500 QTRAP
特點:高分辨,DDA檢測模式

代謝組學
Luo P, Yin P, Zhang W, et al. Optimization of large-scale pseudotargeted metabolomics method based on liquid chromatography-mass spectrometry[J]. Journal of Chromatography A, 2016, 1437:127-136.

Biotree高通量靶標(相對定量)技術

儀器:6600 TripleTOF + 6500 QTRAP
特點:針對文獻已報道擬靶標技術進行升級,綜合高分辨質譜(Triple TOF)非靶標DDA技術高分辨、廣覆蓋、通量高優勢及三重四級桿質譜(QQQ)靶標MRM技術高靈敏度、精確定量、動態范圍寬、重復性好的新型代謝組學檢測方法。

1
技術路線
      
首先用高分辨質譜對樣品進行超高覆蓋率的二級質譜掃描,以獲取“所有”代謝物的二級譜圖 (MS2);然后從中提取MRM離子對信息對樣本進行特異性建庫,再利用三重四極桿質譜MRM技術定量檢測。

代謝組學

2
實驗流程

BIOTREE提供一整套植物高通量靶標代謝組學技術解決方案,包括樣本收集、樣本儲存、樣本前處理、上機檢測、原始數據處理、統計分析、功能機制研究。    
   
代謝組學

3
技術優勢
     
先進的質譜平臺

全覆蓋:TripleTOF全面定性探索,二級譜圖數量更多,碎片信息更全;
高靈敏:速度快、靈敏度高、線性范圍廣的QTRAP可以提供最理想的定量限;
多層次:DDA/IDA與MRM/SRM相結合,優勢互補。

代謝組學
嚴格的質控體系

過程質控

TIC疊圖:QC樣本TIC出峰保留時間和峰面積都重疊很好,說明儀器穩定性很好;
BLANK殘留:空白樣品中無顯著峰檢出,說明物質殘留控制的很好。不存在樣品間的交叉污染。

數據質控

二維PCA:系統穩定性,差異越小說明整個方法穩定性越好數據質量越高;
一維PCA:系統穩定性,有QC樣本分布于2STD之內,說明數據質量很高;
QC相關性:系統穩定性,QC樣本相關性越接近于1,說明整個方法穩定性越好數據質量越高。

代謝組學 

物質鑒定可信度高 

BIOTREE構建高分辨植物代謝數據庫,鑒定結果可信度最高可達到 Level 0。

代謝組學
Software Tools and Approaches for Compound Identification of LC-MS/MS Data in Metabolomics  

強大的數據處理軟件    

SIMCA軟件(BIOTREE科技是Sartorius Stedim Data Analytics AB大中華區SIMCA軟件銷售及培訓服務提供商):針對多變量大數據集,SIMCA 可有效進行模型構建和分析,通過 OPLS、OPLS-DA和O2PLS 等分析模塊可排除噪音以獲得有效數據,并對數據進行可視化、分類和預測;
自主開發多組學關聯分析深度算法:深度個性化數據挖掘解析。   

代謝組學

4
注釋信息

自建高分辨質譜數據庫,包含9600+植物初生、次生代謝物;中英文名稱對照信息、KEGG注釋、自建數據庫物質分類Biotree.Class。

   

代謝組學


OTCML中藥高分辨液質數據庫,以《中國藥典2015 版》收錄的中藥材為參考,包含1200余種中藥對照品的質譜數據和色譜保留時間信息。

  
代謝組學

5
項目經驗

BIOTREE植物高通量靶標代謝組學經驗豐富,實測包括桃子果肉、水稻種子、擬南芥、西洋參種子、人參表皮等超100種不同來源的植物樣本,并同時使用Biotree DB高分辨植物代謝數據庫和OTCML中藥高分辨液質數據庫進行代謝物鑒定。部分項目鑒定代謝物(Level 0 鑒定 + Level 1鑒定)近1000個,同時提供中英文名稱對照信息及物質所屬分類信息。

有需要BIOTREE植物高通量靶標代謝組學檢測分析服務的老師,歡迎在文末留言或者垂詢服務熱線:400-664-9912。


代謝組學


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