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第一屆全國代謝組學及蛋白質組學雙星峰會 | 大咖觀點精彩回顧

分類:公司動態   發布時間 2020-08-28   閱讀: 2280

2020年8月21-22日,由南京江北新區生物醫藥公共服務平臺和上海百趣生物醫學科技有限公司共同組織的“第一屆全國代謝組學及蛋白質組學雙星峰會”線上線下雙平臺盛大召開。


代謝組學

峰會現場


峰會伊始,江北新區黨工委委員、管委會副主任陳潺嵋和南京醫科大學黨委常委、副校長李建清為開幕式致辭。

會上,江北新區生物醫藥公共服務平臺與南京醫科大學第四附屬醫院合作共建的精準醫學中心項目,與南京醫科大學合作共建的質譜轉化平臺項目,與南京百趣生物科技有限公司合作共建的代謝組學平臺項目先后簽約。

代謝組學

代謝組學平臺項目簽約


隨后國家健康醫療大數據(東部)中心“寧康計劃”順勢啟動,該“計劃”是江北新區依托“基因之城”建設成果打造的個人基因檢測服務項目,通過行業領先的基因測序中心和大數據存儲與超算中心的專業技術能力,利用高通量測序技術為居民提供高發病種、遺傳病、慢性病等篩查服務。

緊接著國內眾多質譜研究領域的專家學者從不同角度分享代謝組學、蛋白質組學等領域的新發展、新技術及其在生命科學領域的新應用,內容新穎、豐富,為全國高校、醫院、研究所等組學研究領域的科研人員提供了一個高水平的學術交流平臺。

下面整理了各報告嘉賓演講的主要內容,以饗讀者。

1
夏彥愷:代謝組學分析在毒理學研究中的應用

代謝組學

夏彥愷教授作報告

夏彥愷教授從代謝組學和毒理學的關系以及代謝組學分析在毒理學研究中的應用和技術與大家進行分享和交流。最后,他強調了以下五點內容:

高覆蓋的定量分析(多平臺組合):獲得比較全、比較準確的信息。

多組學數據信息整合:代謝組學要和蛋白質組學、基因組學或者是菌群的宏基因組進行相關的調查分析或者數據整合,可以產生很多新的思路,同時也是對結果一個側面的驗證。

數據庫的建立:數據庫除了用開源數據庫、公司數據庫、儀器商數據庫之外,可以針對自己研究的目標和方向建立特色數據庫,將會有助于你的分析,也可以運用最新的研究成果,這樣效率會高一些。

代謝組學發現向應用轉化:代謝組學未來的價值一定不是僅僅用于基礎研究,它未來的價值一定是運用到臨床當中去,在不久的將來代謝組學會大批量運用到臨床診斷中。

發展中的精準毒理學:目前,很多化合物、代謝物信息的建立都是零零散散的,用更規范、更完整的整合數據和數據庫進行精準毒理學研究,對于環境化合物的危險性數據及環境毒理的危險因素進行精準的分析、一覽無余的篩查和防治策略的制定等,是一個非常重要的方案。

2
尹慧勇:Metabolomics and metabolic flux analysis in cancer research


代謝組學

尹慧勇研究員作報告

尹慧勇研究員認為多組學的整合已經是研究復雜疾病的非常重要的手段。他還用生動的例子為現場的參會人員講解代謝組學和代謝流。

代謝流和代謝組學不一樣。代謝流主要反映生物體內代謝的變化,有一個時間維度在里面,就像車的流量的變化。有的時候路上的車比較多,就像我們的代謝物比較多,但它的變化不太大。代謝流的變化是什么,就是它流量的變化,車子少,但它的速度變化很大。代謝組和代謝流反映的生物體系整個代謝的變化是不一樣的。

最后,他強調質譜組學、代謝組學和代謝流分析技術在腫瘤的代謝中是非常重要的,特別是做科研的老師,現在做腫瘤的代謝,做代謝流分析是必須的。

3
朱正江:Ion Mobility Collision Cross-Section Atlas for Known and Unknown Metabolite Annotation in Untargeted Metabolomics


代謝組學

朱正江研究員答疑

朱正江研究員和大家分享了代謝組學的前沿技術:離子淌度質譜技術。他認為未來5年離子淌度質譜技術肯定會成為代謝組學和脂質組學研究的一個重要主流,會替代現在的LC-MS升級為LC-IM-MS,逐漸走入到每一個實驗室,因為它確實可以提供四維代謝組學和脂質組學分析。

離子淌度質譜技術最重要的核心是碰撞截面積(CCS),基于此朱正江老師團隊研發了一個強大的平臺——AllCCS(http://allccs.zhulab.cn),該平臺支持離子淌度質譜技術的各種應用,可以幫助大家去做多維的匹配,既可以做已知代謝物的鑒定,也可以做未知代謝物的鑒定,并且免費提供給大家使用。

4
薛艷鋒:重度限飼誘發妊娠后期湖羊母子肝臟脂質代謝紊亂的機制


代謝組學

薛艷鋒博士作報告

薛艷鋒博士給參會人員詳細地講解了該課題的研究背景、思路、過程和結論。該研究創新點為:明確了湖羊妊娠后期重度限飼對母體和胎兒肝臟代謝穩態尤其是脂質代謝的影響及其分子機制;發現了重度限飼降低妊娠后期湖羊母體和胎兒肝臟抗氧化能力,引起氧化應激;證實了PPARA/RXRA信號通路可被NEFAs所激活,也可被BHBA所抑制,激活PPARA/RXRA信號通路可減輕肝臟細胞的脂質代謝紊亂,緩解氧化應激。

5
吳洪強:大隊列非靶代謝組學研究方案


代謝組學

吳洪強(BIOTREE CTO)作報告

吳洪強(BIOTREE CTO)老師著重介紹了大隊列非靶代謝組學研究過程中的質量控制。那么持續時間長,樣本量龐大,收集樣本過程復雜的大隊列研究如何做到數據準確可靠?他認為可以從以下三點著手:檢測方法準確可靠;定性方面要有強大的數據庫;定量時檢測過程要有過程控制,數據部分要有數據質控。每一步都去把控數據質量,這樣輸出的結果才是一個可靠的結果,結論才是一個可靠的結論,這樣研究才有意義,否則基礎打不牢,上層建筑也是不牢固的。

6
姚衛峰:代謝組學助力中藥經典名方二至丸藥效物質及作用機制研究


代謝組學

姚衛峰教授作報告

姚衛峰教授報告的內容主要分為兩個部分:基于整合代謝組學的二至丸作用機制研究和基于細胞代謝組學的二至丸藥效物質研究。

整合代謝組學在獲得不同分析平臺、不同來源生物樣品的代謝組學數據后,綜合分析顯著性代謝物及其代謝通路,拓寬了顯著性代謝物的搜尋范圍,可以為中醫藥多途徑、多靶點的整體調控作用理論研究提供依據。

體外藥理研究具有快捷迅速、敏感特異、條件易控等優點,在藥物的活性篩選、毒性評價與深入的細胞分子藥理等研究中起重要作用。中醫藥作用機制研究和藥效物質篩選可借鑒之,如細胞代謝組學。

細胞代謝組學:利用高通量的檢測技術對細胞內外的小分子代謝物進行定性和定量分析研究,觀察細胞內外代謝物的濃度變化,從整體的角度系統全面地觀察細胞水平上代謝變化及其機制的一種代謝組學。

7
胡澤平:代謝組學:從分析技術到疾病代謝研究與治療靶點發現


代謝組學

胡澤平研究員作報告

胡澤平研究員在報告中指出代謝異常在疾病發病機制中起關鍵作用;疾病代謝機制研究將提供藥物新靶標;代謝組學是疾病代謝機制研究的重要技術。

胡老師建議:如果你一定要去看非常獨特的一些生物標志物,或者非常少見的代謝物可以選擇非靶向代謝組學,可能你必須選擇非靶向代謝組學,但是你在做一些常規的生物標志物或者你想做功能和機制的研究,靶向代謝組學和非靶向代謝組學都可以滿足你的要求。

最后,胡老師強調代謝組學確實是非常重要的工具,通過發展新型技術,幫助我們研究疾病的代謝,發現疾病的代謝機制,進而發現新型的治療靶標。

8
劉志鵬:代謝物溯源在腸道微生態中的研究應用

代謝組學

劉志鵬總監作報告


對于人體來說最主要的研究路線就是三大條:case control 相關研究去找里面的差異;根據人群時間隊列研究;人群干預實驗研究。通過不同的方向去找到對應的顯著性的差異,看哪些是共同的影響因素,將這些因素通過動物實驗再去驗證,進而轉化到臨床、人體真實的使用上。

9
段大躍:精準醫學之表型組學新釋


代謝組學

段大躍教授作報告

現代西醫基于某個生理系統或器官的病理變化的一個或多個臨床表型(clinical phenotype)來定義“疾病”和進行疾病的分類(taxonomy)及診斷和治療系統,與現代基因組學、蛋白質組學、代謝組學等對疾病的認識嚴重不匹配,需要從根本上改變為以臨床表型組(clinical phenome)精確定義“疾病”和分類診治系統,即所謂“精準醫學"。

傳統中醫學因時、因地、因人制宜地根據整體機能動態變化的病因、性狀、部位、范圍、環境等要素的綜合臨床表現定義為“證候”即臨床表型組(clinical phenome)進行疾病的分類(taxonomy)及辨證論治,實際上就是臨床表型組學(clinical phenomics)的具體應用。

中醫證候表型組學,通過建立證候隊列和數據庫,整合應用基因組學、蛋白質組學、代謝組學、表觀基因組學、宏基因組學等最新前沿科學技術對中醫的證候、方劑及新藥開發以及辨證論治理論和臨床實踐進行系統研究,對于中醫辨證論治理論和臨床實踐、方劑藥理機制及新藥研究開發的意義,不僅僅在于它是否能將中醫臨床循證以全新的整合組學概念來進行科學的總結和定義,而且更重要的是可以為解決精準醫學時代西醫學所面臨的如何對疾病進行重新定義提供指導思想,而使目前西醫以人體器官甚至細胞或分子表型為基礎的疾病定義和分類,提高到一個新的整體水平,以表型組來對疾病進行定義和分類,創立新的精準醫學。

表型組學方法將作為基因組學、蛋白質組學、代謝組學分析的有效對應方法,逐漸成為新世紀生命科學研究的前沿領域而得到飛速發展。隨著人們將表型組學系統性地與基因組學、蛋白質組學、代謝組學等研究的有機結合的不斷深入,必將出現更令人振奮的成果,這些成果將很快應用于人類健康、疾病預防、臨床診斷和治療各個方面,實現現代醫學的革命性轉化。

10
田志新:結構特異定量N-糖蛋白質組學及在新冠病毒重組疫苗及癌癥潛在生物標志物分析中的應用


代謝組學

田志新教授作報告

田志新教授主要致力于結構特異定量N-糖蛋白質組學方法的開發,實現位點和結構,尤其是結構特異性的解析,可以去賦予它結構診斷性質,是串聯質譜特有的特征。田教授將N-糖蛋白組研究應用于新冠病毒重組疫苗和癌癥潛在生物標志物中,取得不錯結果,F在這一方法正逐漸在細胞模型、臨床的癌組織、癌旁組織、血清對照中進行研究。

11
程劍輝:METHOD DEVELOPMENT AND PROTEOMIC APPLICATIONS OF NONAQUEOUS CAPILLARY ELECTROPHORESIS MASS SPECTROMETRY


代謝組學

程劍輝博士作報告

隨著蛋白質譜技術的發展,發現會存在有些分析物無法溶解于水,有時候蛋白量少無法滿足檢測需要的情況,因此,針對現有的蛋白質譜技術LC-MSMS,陳大勇老師團隊進行了毛細管電泳質譜技術的研究,取得不錯的結果:樣本需求量更低,不錯的肽段鑒定個數,對于短肽和長肽檢出率更好。通過毛細管電泳質譜技術,可對不溶性的代謝組和脂質組進行很好的研究,同時可適用于蛋白大分子和O-糖蛋白組的研究。新的毛細管電泳質譜技術為不同研究對象提供更多更廣的可能。

12
張旭敏:蛋白質末端組學的研究


蛋白質組學

張旭敏研究員作報告

在蛋白質組學研究里面蛋白質修飾往往發揮重要的生物學作用。蛋白質末端存在多種多樣的修飾,N端發現的比較多,C端研究的較少,主要原因是鑒定方法一直沒有得到很好的突破。通常蛋白質的C-端容易發生甲基化,酰胺化,而N-端容易發生乙;,N-端乙;c蛋白各種功能都息息相關,比如蛋白組裝、穩定性和活性、蛋白質降解、細胞凋亡、亞細胞定位。因此,研究蛋白質末端有很重大的生物學意義。

張旭敏老師對末端蛋白組學進行了深入研究,針對N-末端乙;鞍捉M研究,主要在富集方法上進行優化,采用ENCHANT富集法,可以實現更高的蛋白質鑒定能力,結果與常規蛋白質組分析具有很好的互補性;同時對C-末端也進行了研究,構建了目前最大的C-末端庫。為蛋白質的末端研究提供了很好的技術路線和科學參考,具有重要的科學意義。

13
黃敏:超高分辨Orbitrap質譜-蛋白質科學研究的利器


蛋白質組學

黃敏博士作報告

黃敏博士與參會人員分享了賽默飛Orbitrap質譜在蛋白質科學應用中的新技術、新方向及對科研工作的幫助。

除了主題演講安排外,本次峰會的組織方還悉心安排“質譜檢測與分析中心和南京百趣生物”參觀環節,國內高校、科研院所、醫院的專家學者一同蒞臨參觀了質譜檢測與分析中心和南京百趣生物,百趣生物CTO吳洪強為專家學者們介紹了南京百趣生物、質譜檢測與分析中心的質譜設備、檢測路線以及在不同行業的具體應用。

代謝組學
參會人員參觀南京百趣生物

代謝組學
參會人員參觀質譜檢測與分析中心


代謝組學

質譜檢測與分析中心一角

第一屆全國代謝組學及蛋白質組學雙星峰會圓滿落幕,高質量的日程安排、代謝組學和蛋白組學大咖齊聚、高水平的學術講座博得了參會人員的一致好評。


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